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贝类的药用价值很高，中药名称为“石决明”的鲍壳，经处理后可治眼疾；宝贝的贝壳叫“海巴”，能明目解毒。大家都知道，珍珠是名贵的中药材，具有清热、解毒、平肝潜阳、镇静安神、止咳化痰、收敛生肌和明目止痛的效果，利用珍珠层粉配置的成药如六神丸、小儿回春丹、行军散、八宝眼药、千锤膏、安宫牛黄丸、复方哮喘散等已经在民间得到广泛应用，用马氏珍珠贝珍珠层粉注射液治疗病毒性肝炎有明显的效果。乌贼的内壳称之为“海螵蛸”，具有止血的功能，可用于治疗外伤；用乌贼的墨汁治疗子宫出血效果良好；短蛸的提取物对肉瘤有明显的抑止作用。此外，海兔和瓜螺的卵群也能作药，对于消炎退热，头晕发烧、肺燥喘咳也有疗效。据知目前至少有30种以上贝类的肉、壳和厣在药用方面得到使用。
在工农业方面贝类的用途也比较广泛，因贝壳的主要成分是碳酸钙，是烧石灰的原料，在我国东南沿海农村许多土法烧灰窑，就是使用牡蛎、贻贝、锥螺等数量庞大的贝壳烧灰；而珍珠层厚实的马蹄螺、蝾螺等，它们的贝壳经打磨加工可制作高级衬衫纽扣，其壳粉与油漆混合尚可作为喷漆调和剂；乌贼的内骨骼是优质牙膏和活性碳的原料，乌贼等头足类的墨汁可制成世界闻名的“中国墨”；从骨螺等贝类提取的紫色腺可作染料，总之，贝类在工业上有它一定的特别用途。在农业上，许多小型贝类可作家禽的辅助饲料或作养殖鱼虾的饵料，上海郊区养殖对虾主要饵料就是螺蛳、蚬子，如将一些所谓“低值贝类”打成粉桨调匀在饲料中，能增强家禽体质、增加免疫力。
贝类的观赏价值也很高，贝雕工艺完全是由各种贝类装饰而成，这种美术工艺品可与木雕、玉雕和象牙雕相媲美，它具有自己的独特风格，深得人们钟爱。我国古代的“螺钿”是用贝壳镶嵌在木器上的艺术品，非常珍贵，但更多的人还是青睐于贝壳的千姿百态、千奇百怪的形姿，艳丽的色彩也非常诱人。
当然贝类也有对人不利的一面，有些淡水或陆生的贝类是人体或家禽寄生虫的中间宿主，例如日本吸血虫的幼虫就是寄生在钉螺体内；海水中的海笋、船蛆是专门穿木凿石的种类，它们对设置在水中的木桩及海港建筑物危害极大；另有附着性或营固着生活的贝类，如贻贝、牡蛎等大量固着在船底时就会影响航速，如果固着在沿海工厂的冷却管道系统中，就会堵塞水管、造成水流不畅，影响生产；一些肉食性的贝类如红螺、玉螺，它们会残害养殖贝类的幼贝而成为养殖敌害，而食植物的贝类又对海带、紫菜幼苗造成一定的伤害。 | 
